Từ ngày 01/7/2026, nhiều quy định mới về thuế, đăng ký thuế, hóa đơn điện tử và quản lý tuân thủ, quản lý rủi ro trong lĩnh vực thuế chính thức được áp dụng. Để hướng dẫn triển khai các luật thuế và nghị định mới, Bộ Tài chính đã ban hành 04 thông tư quan trọng mà doanh nghiệp, kế toán và hộ kinh doanh cần chủ động cập nhật.

Dưới đây là những nội dung đáng chú ý của 04 thông tư có hiệu lực từ ngày 01/7/2026.

1. Thông tư 87/2026/TT-BTC – Hướng dẫn Luật Thuế thu nhập cá nhân

Thông tư 87/2026/TT-BTC hướng dẫn thực hiện các quy định liên quan đến Luật Thuế thu nhập cá nhân số 109/2025/QH15 và Nghị định 253/2026/NĐ-CP.

Một số nội dung chính:

• Quy định về thu nhập chịu thuế, miễn thuế và giảm trừ gia cảnh;

• Hướng dẫn khấu trừ thuế và quyết toán thuế thu nhập cá nhân;

• Quy định về thu nhập từ kinh doanh, tiền lương, tiền công;

• Làm rõ một số quy định áp dụng từ kỳ tính thuế năm 2026.

Thông tư có hiệu lực từ 01/7/2026 và thay thế Thông tư 111/2013/TT-BTC.

Lưu ý: Doanh nghiệp và cá nhân có phát sinh nghĩa vụ thuế thu nhập cá nhân cần rà soát lại chính sách tính thuế, khấu trừ và quyết toán để phù hợp với quy định mới.

2. Thông tư 90/2026/TT-BTC – Hướng dẫn về đăng ký thuế

Thông tư 90/2026/TT-BTC tập trung hướng dẫn các quy định mới về đăng ký thuế, trong đó đẩy mạnh việc sử dụng dữ liệu số và kết nối thông tin phục vụ quản lý thuế.

Những điểm đáng chú ý:

• Sử dụng số định danh cá nhân làm mã số thuế.

• Hướng dẫn đăng ký thuế điện tử, kết nối với Cơ sở dữ liệu quốc gia về dân cư.

• Đăng ký thuế đối với thương mại điện tử và kinh tế số.

• Tăng cường khai thác dữ liệu phục vụ công tác quản lý thuế.

Thông tư có hiệu lực từ 01/7/2026.

Đây là nội dung đặc biệt đáng quan tâm đối với cá nhân kinh doanh, hộ kinh doanh, người nộp thuế có hoạt động trên nền tảng thương mại điện tử và các tổ chức, cá nhân thực hiện thủ tục đăng ký thuế.

3. Thông tư 91/2026/TT-BTC – Hướng dẫn về hóa đơn điện tử, chứng từ điện tử

Thông tư 91/2026/TT-BTC hướng dẫn thực hiện các quy định về hóa đơn điện tử, chứng từ điện tử theo Nghị định 254/2026/NĐ-CP.

Một số nội dung cần lưu ý:

• Quy định về lập, nội dung và thời điểm lập hóa đơn điện tử.

• Hướng dẫn xử lý trường hợp hóa đơn có sai sót, bao gồm điều chỉnh, thay thế và hủy theo quy định.

• Hướng dẫn đăng ký sử dụng chứng từ điện tử.

• Ban hành các mẫu hóa đơn và chứng từ điện tử mới.

• Điều chỉnh các quy định để phù hợp với hệ thống pháp luật mới về hóa đơn, chứng từ.

Thông tư có hiệu lực từ 01/7/2026 và thay thế Thông tư 32/2025/TT-BTC.

Doanh nghiệp cần làm gì?

Doanh nghiệp cần chủ động kiểm tra lại quy trình lập và xử lý hóa đơn điện tử, đặc biệt là các trường hợp hóa đơn sai sót, điều chỉnh, thay thế và việc sử dụng chứng từ điện tử để hạn chế rủi ro trong quá trình kê khai, hạch toán và quyết toán thuế.

4. Thông tư 94/2026/TT-BTC – Quản lý tuân thủ và quản lý rủi ro trong quản lý thuế

Thông tư 94/2026/TT-BTC hướng dẫn về quản lý tuân thủ và quản lý rủi ro trong quản lý thuế.

Đây là một trong những nội dung đáng chú ý đối với doanh nghiệp bởi hoạt động quản lý thuế ngày càng được thực hiện dựa trên dữ liệu và mức độ rủi ro của người nộp thuế.

Các nội dung chính:

• Quy định về nguyên tắc, tiêu chí đánh giá mức độ tuân thủ của người nộp thuế.

• Phân loại và xác định mức độ rủi ro của người nộp thuế.

• Áp dụng quản lý rủi ro trong các hoạt động như:

  • Đăng ký thuế;

  • Khai thuế;

  • Hoàn thuế;

  • Nợ thuế;

  • Hóa đơn;

  • Kiểm tra, thanh tra thuế.

• Sử dụng kết quả phân tích rủi ro để lựa chọn biện pháp quản lý phù hợp.

Thông tư có hiệu lực từ 01/7/2026 và thay thế Thông tư 31/2021/TT-BTC.

04 THÔNG TƯ MỚI – DOANH NGHIỆP CẦN ĐẶC BIỆT LƯU Ý GÌ?

Việc 04 thông tư cùng có hiệu lực từ ngày 01/7/2026 cho thấy hệ thống quản lý thuế đang có nhiều thay đổi theo hướng đồng bộ pháp lý, số hóa dữ liệu và quản lý dựa trên rủi ro.

1. Đồng bộ với hệ thống pháp luật thuế mới

Các thông tư mới được ban hành nhằm hướng dẫn triển khai các luật và nghị định thuế có hiệu lực từ ngày 01/7/2026. Do đó, doanh nghiệp không nên tiếp tục áp dụng máy móc các quy trình cũ nếu đã có quy định mới thay thế.

2. Đẩy mạnh quản lý thuế trên nền tảng số

Việc sử dụng dữ liệu điện tử, số định danh cá nhân, hóa đơn điện tử và kết nối dữ liệu giữa các cơ quan quản lý đang ngày càng được tăng cường.

Điều này đòi hỏi doanh nghiệp phải chú trọng hơn đến tính chính xác, đầy đủ và nhất quán của dữ liệu thuế, kế toán và hóa đơn.

3. Quản lý thuế chuyển mạnh sang phương thức dựa trên rủi ro

Cơ quan thuế có thể sử dụng các tiêu chí và dữ liệu để đánh giá mức độ tuân thủ, phân loại rủi ro và lựa chọn biện pháp quản lý phù hợp.

Vì vậy, việc duy trì hồ sơ kế toán – thuế đầy đủ, số liệu nhất quán và thực hiện đúng nghĩa vụ thuế ngày càng có ý nghĩa quan trọng đối với doanh nghiệp.

4. Hoạt động thương mại điện tử và kinh tế số được chú trọng

Các quy định mới về đăng ký thuế và quản lý thuế tiếp tục tăng cường quản lý đối với hoạt động thương mại điện tử, kinh tế số và các mô hình kinh doanh trên nền tảng số.

Các cá nhân, hộ kinh doanh và doanh nghiệp có hoạt động kinh doanh trực tuyến cần chủ động rà soát nghĩa vụ đăng ký, kê khai và thực hiện nghĩa vụ thuế theo quy định mới.

BẢNG TÓM TẮT 04 THÔNG TƯ CÓ HIỆU LỰC TỪ 01/7/2026

DOANH NGHIỆP, KẾ TOÁN VÀ HỘ KINH DOANH NÊN CHỦ ĐỘNG RÀ SOÁT

Trước những thay đổi mới, doanh nghiệp, kế toán và hộ kinh doanh nên chủ động:

Thứ nhất, cập nhật các quy định mới về thuế và đăng ký thuế, đặc biệt đối với việc sử dụng số định danh cá nhân và dữ liệu điện tử.

Thứ hai, rà soát quy trình lập, kiểm tra, điều chỉnh và xử lý sai sót hóa đơn điện tử.

Thứ ba, kiểm tra tính thống nhất giữa hồ sơ kế toán, hóa đơn, chứng từ, tờ khai thuế và dữ liệu giao dịch.

Thứ tư, đánh giá lại các vấn đề có thể làm tăng mức độ rủi ro về thuế, từ đó chủ động khắc phục trước khi phát sinh kiểm tra hoặc thanh tra.

Thứ năm, đối với hộ kinh doanh và cá nhân kinh doanh trên nền tảng số, cần đặc biệt lưu ý các quy định mới liên quan đến đăng ký thuế, thương mại điện tử và kinh tế số.

KẾT LUẬN

04 thông tư của Bộ Tài chính chính thức có hiệu lực từ ngày 01/7/2026 là những văn bản quan trọng, tác động trực tiếp đến hoạt động thuế thu nhập cá nhân, đăng ký thuế, hóa đơn điện tử và quản lý tuân thủ, quản lý rủi ro thuế.

Trong bối cảnh cơ quan thuế ngày càng đẩy mạnh số hóa, kết nối dữ liệu và quản lý dựa trên rủi ro, doanh nghiệp không chỉ cần thực hiện đúng nghĩa vụ thuế mà còn cần bảo đảm hồ sơ, chứng từ và dữ liệu kế toán – thuế được quản lý đầy đủ, chính xác và nhất quán.

Việc cập nhật quy định mới và rà soát lại quy trình ngay từ đầu sẽ giúp doanh nghiệp hạn chế sai sót, chủ động giải trình và giảm thiểu rủi ro trong quá trình quản lý thuế.